В 1833 году на его базе образован был Свято-Троицкий мужской монастырь, при нём Братское монастырское кладбище. Информации об этом погосте сейчас уже нет почти никакой, но логично предположить, что хоронили на нём обычно священнослужителей и монахов Свято-Троицкого монастыря, различных лиц духовного сословия. Свято-Троицкий некрополь дал последний приют многим замечательным людям, которые, не смотря на свой духовный сан, сделали очень много для города и его жителей.
Некоторые же из них могут считаться даже достоянием страны, её героями. Взять, например, самое раннее захоронение - 1736 года. Архиерей Епифаний Тихорский в своё время внёс огромнейший вклад в развитие образования, основав школу и так называемый Харьковский коллегиум. И 1919 год, Советская власть и замученный её представителями епископ Белгородский Никодим (Александр Кононов, 1871 года рождения).
В 1893 году захоронен здесь иеромонах Вениамин, умерший в возрасте 80 лет. Кроме всего прочего, этот человек был назначен корабельным священником на «Трёх святителей» и в этом качестве участвовал в Синопской битве, последним оставив идущий ко дну корабль. Будучи переведённым вместе с командой погибшего корабля на 34-й бастион, пережил здесь все 11 месяцев осады Севастополя. И всё это время добросовестно выполнял свои священнические обязанности, за что был, неоднократно награждаем.
С первых лет Советской власти началось планомерное разрушение святынь. Монастырь закрыли в 1920 году, собор разбирался и растаскивался беспризорниками и красноармейцами, а в 1930-м году было взорвано всё, что ещё оставалось. На месте старинного некрополя построены дома, при сооружении которых постоянно натыкались на человеческие кости и вывозили их вместе с выкопанной землёй. Как выглядело когда-то старинное монастырское кладбище, сегодня мы можем узнать разве что по открытке, сохранившейся в частной коллекции с начала ХХ века.
Что сохранилось от старинного некрополя до наших дней, это один-единственный надгробный камень. И то он сохранился только благодаря тому, что находился в неприметном месте в зарослях кустов. Такое отношение к памяти потомков вызывает только сожаление.
