В соответствии с повелением, кладбище было ограждено, окопано рвом и обнесено валом. Соорудили на нём и церковь, сначала деревянную, заменённую потом на каменный храм. Уже в ХІХ веке в него перенесли престолы из старого храма, великомученика Никиты в том числе, и храм освящён был во его имя. Храм действовал даже во времена советской власти, прекращал деятельность только во Вторую мировую войну. До наших дней сохранилась его внутренняя роспись, четырехрядный иконостас. Здание храма является достопримечательностью города, местным архитектурным памятником.
Любое место захоронений со временем приобретает некоторый покров таинственности, загадочности. Старинный Никитский некрополь – не исключение. Одна из загадок, например: как могла купчиха Гладкова, Анна Фёдоровна, скончаться 31 февраля? Наиболее правдоподобна версия на этот счёт, что гравер просто ошибся – или месяцы перепутал, или, увлёкшись, приписал лишнюю единицу. А может, пошутить решил таким образом. Сын же купчихи Антон, захороненный рядом, скончался в возрасте 27 лет, 27 апреля 1827 года. Высказываются предположения, что эти две могилы вообще смогли уцелеть до нашего времени благодаря таким интересным особенностям. Необычные надгробия не использовали для строительства или мощения улиц, как было принято во времена индустриализации.
С Никитским кладбищем связана также легенда о «плачущей» статуе. На протяжении ряда лет кто-то старательно поддерживал эту легенду, тайком дорисовывая «слёзы» на одной из надгробных скульптур. Каждую ночь в глубине кладбища мерцает огонёк, пугая всех своим таинственным светом. Это лампадка на могиле монашки, зажигаемая священниками ежевечерне.
В 1860 году возле стен Никитского храма появилась могила Ф.А. Семёнова. Захоронение известного астронома венчал памятник в виде колонны с чашей и крестом – символом христианства. После революции наземную часть захоронения перенесли на главную аллею погоста, Чашу с крестом заменили шаром, обвитым лентой, на которой изображены зодиакальные созвездия.
Из воинских захоронений самое старинное, подполковника Цурикова Н.И., датируется 1844 годом. Более поздние сделаны были в начале ХХ столетия. Находится здесь также могила Героя Советского Союза Перекальского Н.С. В 1941 году, после первой бомбёжки, захоронены в братской могиле погибшие мирные жители Курска.
Кладбище закрыто для захоронений с 1970-х годов ХХ века.