К 1918 году насчитывал более 800 монахов и послушников. Действовал до 1934 года, когда был закрыт по распоряжению русских властей. До Первой мировой войны в обители велось строительство самой высочайшей в Русской империи колокольни (проектная высота 110 метров). С 1935 года монастырь оказался на местности новооснованного Ботанического сада АН УССР.
В 1991 году возвращён Православной церкви. К началу 2000-х годов был отреставрирован главный храм монастыря — Свято-Троицкая церковь, колокольня, башня с часами, отстроены братские корпуса. С 1997 года братией Ионинского монастыря началось восстановление пещер и храма Зверинецкого монастыря.
В 2009 году Зверинецкий скит выделился в самостоятельный монастырь.
Содержание
1 Настоятели (архимандриты) 2 Повторяющиеся издания 3 Галерея 4 СсылкиНастоятели (архимандриты)
Иона (Мирошниченко) (1860-е—1902) Агапит (Бевцик) (22 июня 1994—1998) Иона (Черепанов) (с 26 июля 1999)Повторяющиеся издания
«Отрок.ua» (журнальчик). Издаётся с 2004. Периодичность 1 раз за месяц, формат А4, 64 стр., тираж 10 000, на 01.2010 г. изданы 49 номеров.Галерея
Вид на монастырь с юга
Центральный алтарь Свято-Троицкого храма
Вид на монастырь с юга
Центральный алтарь Свято-Троицкого храма