При пустыни находится Синодальный свечной завод также кладбище, где покоятся ряд узнаваемых деятелей Российской забугорной церкви.
История
В 1949 году князь и княгиня Белосельские-Белозерские, узнав о готовившемся переселении Архиерейского Синода и чудотворной Курско-Коренной иконы в США, безвозмездно предоставили Российской Забугорной Церкви в распоряжение своё пригородное имение около Магопака, в 40 милях от Нью-Йорка. В этом имении, с благословения митрополита Анастасия (Грибановского), и было решено устроить ставропигиальное иноческое подворье, которое, по прибытии Синода, могло бы стать временной его резиденцией.
Строителем и настоятелем синодального подворья стал епископ Троицкий Серафим (Иванов), предложивший именовать подворье «Новая Коренная пустынь» в память о разрушенной старенькой Коренной пустыни, где была обретена чудотворная икона. Уже 29 января 1950 года, через 19 дней после приезда архиепископа Серафима в Магопак, была освящена домовая церковь, а после освящения в Новейшей Коренной пустыни была отслужена 1-ая литургия.
В 1952 году Архиерейский Синод переселился в город New-york, где была устроена Синодальная Знаменская церковь с пребыванием чудотворного вида в ней, ибо пребывание в несколько удалённой от центра пустыни препятствовало Архиерейскому Синоду вполне производить свою церковно-общественную деятельность, в особенности в зимнее время.
В 1957 году настоятелем Ново-Коренной пустыни стал архимандрит Иннокентий (Быстров). Братии всегда было мало — около 10 человек, из которых иночествующих было меньше половины. В летнее время в пустынь приезжало много богомольцев. Другие проводили в пустыни свои отпуска, чтоб надышаться, как они гласили, «русским церковным воздухом». Были семьи, которые из года в год проводили с детками всё лето. Для их была устроена маленькая временная гостиница из гаража, а потом была построена настоящая.
В 1981 году архимандрит Иннокентий отошёл ко Господу. После чего на поддержание и развитие обители не выделялось никаких средств. К середине 1990-х годов монахов в Новейшей Коренной Пустыни уже не осталось. Строения и территория равномерно начали приходить в упадок. Кроме богослужений и деятельности синодального свечного завода, жизнь в Пустыни протекала медлительно и тихо. Служил ушедший на покой священник Алексей Дмитриев. В обители произошёл пожар, который фактически уничтожил церковь Рождества Пресвятой Богородицы.
К началу 2000-х годов братии в пустыни уже не было, и большая часть построек на местности пустыни находились в очень запущенном виде. Главный корпус с храмом нуждались в полном ремонте. Рассматривались даже планы снести храм и монастырские постройки, а землю реализовать либо сдать в аренду коммерческим структурам. Но прихожане храма Рождества Пресвятой Богородицы твёрдо решили своими силами сохранить святое место. Прихожан поддержал Первоиерарх РПЦЗ митрополит Лавр, который посетил пустынь в сентября 2004 года.
Летом 2009 года силами энтузиастов были начаты восстановительные работы в Ново-Коренной Пустыни, а в сентябре был основан приход имени Рождества Пресвятой Богородицы при обители. В декабре такого же года состоялось 1-ое заседание рабочей группы по развитию Ново-Коренной Пустыни в Магопаке, на котором дискуссировалось поэтапное расширение начатых работ в основном здании, общее улучшение состояния других строений и создание определенного плана на будущее.
В январе 2010 года протоиерей Виктор Цешковский назначен настоятелем прихода Рождества Пресвятой Богородицы в Магопаке.
Большой энтузиазм к работам по возрождению и реставрации обители, которая должна одним из центров российского зарубежья в США, проявляет Первоиерарх Российской Забугорной Церкви митрополит Иларион, называя её тем местом в истории Российской Америки, которое «сыграло спасительную роль в жизни тыщ наших отцов и дедов и посодействовало им объединиться в единое святое общество, называемое Российская Забугорная Церковь».
