Погост был образован во второй половине ХVIII столетия, приблизительно в одно время с самим городом, и теперь является самым старым. На плане 1829 года отмечено, как официальное городское кладбище. По сути, кладбище в целом является памятником истории, поскольку в ХІХ веке хоронили здесь жителей уездного города того времени. До наших дней сохранились некоторые надгробия представителей самых различных классов и сословий. Рассматривая их, можно воссоздать картину жизни не только этих людей, но и, в какой-то мере, современный им городской быт и культуру.
К сожалению, многие исторические надгробия со временем приобрели не очень презентабельный вид. Некоторые памятники вошли в землю, поросли мхом, некоторые повреждены так, что прочитать надписи на них уже невозможно
Сохранились на кладбище преимущественно купеческие надгробия. Они столь монументальны, изготовлены из настолько прочных и долговечных материалов, что смогли пережить и бурные советские времена.
Храм-часовня на кладбище выстроен был на средства горожан, не последними жертвователями, наверное, были представители семьи Мешкичевых. Членов этого многочисленного семейного клана, по некоторым предположениям, хоронили именно здесь. И.Л.Мешкичев, хлеботорговец, был одним из известнейших и виднейших купцов ХІХ века, о чём свидетельствует памятник на его могиле.
30-е годы прошлого века часовню использовали как «временный морг». Когда было холодно, тут хранились некоторые время трупы расстрелянных, которых было слишком много. Так много, что не успевали хоронить. Теперь на кладбище возведён мемориальный комплекс в память репрессированных. Инициатором выступил архимандрит Никандр, спонсировали строительство бизнесмены.
Чистополь во время войны был местом расположения трёх эвакогоспиталей. В связи с невозможностью транспортировки раненых, госпиталя эти проработали недолго и скоро были расформированы. На месте захоронений в братских могилах воинов, умерших в этих госпиталях, установлены памятники.
Сейчас на воротах старинного Авдеевского кладбища установлена мемориальная доска.